25 年前
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1966年，从新加坡返回香港想忘掉过去的周慕云住进东方酒店的、同他曾经熟悉的数字2046只差一号的2047号房，开始了他的卖文生涯。眼前、曾经在他身边出现过的一个个女人经过他大脑的过影后，令他对时空产生疑惑，不但忘不了过去，一幕幕往事反而更加挥之不去。
为了与过去作更好的告别，他将生活的点点滴滴化为文字，写下小说《2046》（说只要搭上了前往2046的列车，人们就可以找回失去的记忆）。。有鬼医马甲的南依替父顶罪出狱后，被父亲用双胞胎儿子威胁，嫁给司墨寒冲喜后，意外得知自己的小儿子身死，悲痛之际，她意外发现司墨寒的儿子身上有跟自己孩子一模一样的胎记…。