18 年前
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A市出现危害更大的高纯度冰毒——红冰，市缉毒大队副队长马志强深入瘾君子群中打探毒品运输线，在一次抓捕行动中，擒获毒贩秦小伟，他交代了两条供货渠道，马志强以此推断A市存在一定规模的毒品加工窝点。缉毒大队当下决断策反秦小伟，以他为切入口接近制毒集团。马志强化名大阳与秦小伟约上线耀龙接头，不料却遭围杀，小伟当场死亡。小伟的死让他的义姐曾淑娴非常悲愤，马志强伪装成需要大宗毒品的毒贩，在曾淑娴的引荐下与达哥接触。经过几番考验，马志强取得达哥的信任后深入毒窝与大毒枭岳伟豪见面，不料竟被上次围杀他和小伟的蝎子认出，关键时刻缉毒大队赶到。一番械斗后，岳伟豪被捕，达哥被杀，曾淑娴虽死但足月的婴儿诞生，A市恢复平静。。因为偷税事件，曾经处于精英组的百合根友久（冈田将生 饰）被踢到早先成立的科学搜查班（ST）担任指挥官，通过之前的合作，虽然百合根始终未能完全接受青山翔（志田未来 饰）、结城翠（芦名星 饰）、黑崎勇治（漥田正孝 饰）、山吹才藏（三宅弘城 饰）以及ST实际领导者赤城左门（藤原龙也 饰）这群怪人的行径，却也为他们自身那极度专业和见斥于周遭的气息所感染。百合根一面盼望早日回到搜查一课，一面又打算多守护ST的各位一段时间。随着作为后盾的三枝警官（渡部笃郎 饰）的离开和ST新任监查松户紫织（濑户朝香 饰）的到来，ST面临生死存亡的危机。赤门渐渐走出家门，百合根则成为遏止这头怪物不可或缺的重要存在……
本片根据今野敏的原作改编。。