25 年前
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未来世界，人类文明高度发达，智能机器人大量涌现，已在日常生活中占据重要的位置，而且人类为了获得永恒的生命，也尝试将自己改造为机器人。同时，一列名为“银河铁道999号”的宇宙列车担负起连接地球和宇宙文明的使命，星系从此不再遥远。
少年星野铁郎（野沢雅子 配音）的母亲被嗜好杀戮的机械伯爵杀害，他肩负母亲的嘱托，决定前往安达罗星云改造身体，为此不惜在车站抢夺他人的银河铁道999号车票，不过也因此邂逅了容貌与母亲极其相像的梅蒂尔（池田昌子 配音）。凭借梅德尔的帮助，他终于踏上999号列车，继而展开一段充满未知的旅程……
本片为《银河铁道999》第一部剧场版动画。。尚宛（柳承范 饰）是一名巡警，某日遇见小流氓为非作歹，他挺身而出，不过武艺不精，在追击扒手的过程中，不幸被见义勇为的尤金（尹素怡 饰）击中，当场晕倒。因为误伤他的尤金使用了掌风绝技——冲击波。尤金把尚宛带回家中养伤。尚宛却在此遇到了“七真人”。其中，紫云（安圣基 饰）要尚宛跟尤金继承他们的武功。尚宛考虑到从此以后不会再受人凌辱，同时还可以跟心上人尤金成为拍档，便欣然应允。在施工队挖掘地道时，无意中发现了一个巨大的洞穴。从中迸发出的气流，令众人侧目。一个千年的骷髅恢复成白发老人黑云，他窜出了洞穴并利用吸星大法，换成了杂货店店员的年轻躯壳。他开始疯狂地寻找一个可以开启能量气流的钥匙。而只有紫云才了解其中的奥妙。一场正邪大战由此展开……。
