18 年前
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除了画廊Gallery Fake的老板外，藤田玲司（森川智之 配音）还有着另一个神秘身份——王牌赝品制作人，传说中，他所仿造的赝品无人能够识破，而他的画廊也成为了黑市倒买倒卖非法赝品的中转站。高田美术馆的新任馆长三田村小夜子（雪野五月 配音）一向对艺术品市场中的黑暗面深恶痛绝，年轻的她发誓要让这一罪恶的行径彻底杜绝。
已故画家梵高的名作《梦幻之向日葵》的重出江湖震惊了整个艺术圈，而这幅价值连城的画作如今就在藤田的手上。让小夜子感动惊讶的是，藤田居然企图通过她，将画专卖给个人。利用这个难得的机会，小夜子决定和藤田打一个赌，而场赌博也引出了藏匿在这幅名画背后的某些不为人知的秘密。。工藤新一，米花高中二年级学生，与小兰是青梅竹马，两人感情很好。继承了父亲的超强推理能力，被誉为高中生名侦探。他喜欢看推理小说，最崇拜福尔摩斯，另外踢足球的水平也是一流。不幸被卷入黑衣组织的交易被灌下毒药APTX4869，但是没有死，只是变成了小孩，改名江户川柯南（取自两个侦探小说里的人名）。幸亏智力没有衰退，还可以帮着毛利小五郎办案以寻找黑衣组织的线索，而体力上的不足靠阿栗博士的发明来弥补。变小后就读于米花小学1年纪B班，认识了步美、元太、光彦三人，还成立了少年侦探团。不管是变小前后，都是音痴，唱歌走音非常夸张。知道他真实身份的有：阿栗博士、他父母（听博士说的）、服部平次（与柯南一起破案过程中自己发现的）、怪盗Kid（与柯南的较量中自己发现的）、灰原 哀（变小前奉黑衣组织之命调查新一时发现的）。因为变小后有和小兰一起洗澡，还睡同一张床，所以柯南最怕自己的真实身份被小兰知道，否则小兰的空手道攻击可不是说笑的.。
